Το τσουνάμι επιδρά στο περιβάλλον με πολλούς τρόπους, από το θάνατο της θαλάσσιας ζωής μέχρι την καταστροφή των ζωοειδών, των φυτών και την επίδραση στα γεωλογικά χαρακτηριστικά καθώς και την καταστροφή των μαγκροβίων, των κοραλλιογενών υφάλων και της βλάστησης. Υπάρχει έντονη ανησυχία για καταστροφές στους θαλάσσιους οικότοπους και για την επίδραση σε παράκτιες πόλεις που περιπλέκονται με εύθραυστα θαλάσσια συστήματα.
Τα περιβαλλοντικά προβλήματα που προκαλούνται λόγω των τσουνάμι συμπεριλαμβάνουν:
- Ρύπανση υπέργειων υδάτων
- Ζημιές σε κοραλλιογενείς υφάλους, στη βλάστηση του βυθού και στα μαγκρόβια οικοσυστήματα.
- Αλάτωση των εδαφών και καταστροφή της βλάστησης και των καλλιεργειών.
- Σκουπίδια και συντρίμμια που παράγονται από τα τσουνάμι.
- Επιπτώσεις στα συστήματα συλλογής και επεξεργασίας λυμάτων.
- Ζημιές σε προστατευόμενες περιοχές.
- Διάβρωση και κατακλυσμός των ακτογραμμών.
- Αλλαγές στην υδρολογία των ποταμών.
- Απώλεια βιοτικών πόρων που βασίζονται σε φυσικούς πόρους ή υπηρεσίες οικοσυστημάτων.